Один вопрос, почему панель поверх всех окон?

У меня не поверх. И даже нет такой галочки.

Так именно, что такой галочки нет и никогда не было, но панелька висит поверх всех окон.

Увидел, но вопрос остался.

Всю жизнь там галка есть, только она с иконкой вместо чекбокса… В верхнем правом углу.

А, точно, есть такое. Я просто никогда ею не пользовался и потому успел забыть с начала века, как стал пользоваться Бихолдером.

почему приложение прется в System32 и после удаления оставляет там хвост.

Это dll для работы с ИК-пультом в стороннем софте. В system32 она потому что иначе стороннему софту будет сложно её найти.

Не понял, почему оно себя не удалило?

Вероятно потому, что какая-то программа использует эту dll-ку.

При деинсталляции не удаляется "BeholdRC.dll" из "system32", в итоге мусор.

Я проверял, у меня BeholdRC.dll ничего не держит во время деинсталляции BeholdTV

Ну а у PROgR держит. PROgR переустанавливал ПО и существующий занятый файл пытался перезаписаться.
Вы же удаляли ПО и этот файл вам оставили, чтобы не вызывать вопросов "А почему перестал работать пульт ДУ в моей программе???"

Так и зачем мне этот файл, если я удаляю ПО.

Да за тем, что как раз именно у вас стоит какой-то софт, использующий BeholdRC.dll и ПО тюнера при удалении сохранит этот файл, чтобы софт продолжал работать.

Кстати у Меня родной софт работает.